
3月10日(水)広島県東広島市の酒類総合研究所にて統合データベース講習会を開催いたしました。(当日のプログラムはこちら)
独立行政法人酒類総合研究所は日本で唯一のお酒に関する国の研究機関です。その歴史は古く大蔵省醸造試験所として明治37年に設置され、昭和20年には大蔵省主税局醸造試験所と改称、その後国税庁の所轄となるなどを経て、平成13年に独立行政法人として新しくスタートしました。
折しも講習会前日から中国地方は雪となりましたが、所内と所外の広島大から参加された方も含めて27人の方が参加されました。参加者のみなさんにアンケートをとったところ統合DBプロジェクトをご存知であったのは3人でしたので、プロジェクトを知っていただくよい機会となりました。
講習会の質疑応答では、「アノテーションを含め、他のDBからデータを取得したときにデータ形式が統一されておらずがユーザからわかりにくい。なにか良い解決法はあるのでしょうか? データ形式共通化の動きはあるのでしょうか?」「自分のデータでDBを作りたいとき、具体的にはDBCLSにどうやってアプローチしたらよいでしょうか?」といった質問をいただき、DB構築に関して現場の研究者の方が実際にどのように困っておられるのか、どのような点を解決すればよいのかについて、統合プロジェクトにとっても大いに参考になりました。
講習会終了後は、醸造技術基盤研究部門と醸造技術応用研究部門を見学させていただきました。基盤研究部門では麹菌研究グループの実験室を拝見、麹菌ゲノム解析、麹菌EST解析についても話を伺うことができました。国際コンソーシアムで行われた麹菌Aspergillus oryzaeのゲノム配列決定(PMID- 16372010)には酒類総合研究所のRIB40株が使われましたが、まだまだ遺伝子同定並びに機能解析は続いている段階で、データはNITEのDOGANから閲覧できる他、酒類研究所のオリジナルデータを加えたゲノムデータベースAspergillus oryzae RIB 40 genome DB、並びにAspergillus oryzae EST DataBase が利用できます。現在はカスタムアレイも利用し株ごとの性質の違いをゲノムや発現レベルで解析されているそうです。
次の応用研究部門では麹菌や酵母とその酵素を利用した環境保全の研究開発や、バイオディーゼルの生産についてなど、昨今話題の中心である地球環境の問題解決に関連する研究を説明していただき、小さな菌のプラント工場のような実力に大変驚かされました。
最後に製造実験棟を工場見学させていただき、発酵中の日本酒を見せていただくなどしました。全体を通して酒類研究所においてもデータベースは重要なポジションを占めていると強く実感いたしました。
講習会に参加された皆さま、またお世話になりました皆さまありがとうございました。雪景色とともに思い出深い講習会となりました。
ライフサイエンス統合データベースセンター 川本祥子